加强水肥管理，预防病虫害的发生。
化学防治。种子消毒：用55℃温水浸种5分钟后，立即移入冷水中冷却，晾干后催芽播种；或用50%多菌灵500-600倍液浸种20分钟，用清水冲洗干净后晾干播种。喷药防治：发病初期喷洒80%代森锰锌可湿性粉剂600-700倍液、80%代森锌可湿性粉剂500-800倍液、70%丙森锌可湿性粉剂500-800倍液、50%克菌丹可湿性粉剂400-600倍液、75%百菌清可湿性粉剂600倍液、50%异菌脲可湿性粉剂800-1200倍液、72%锰锌霜脲可湿性粉剂600倍液、72%克抗灵可湿性粉剂600倍液、40%波尔多精可湿性粉剂900-1000倍液，隔7-10天1次，连续防治2-3次。
辣椒疫病可以用百菌清进行防治。
在发病初期，用75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或50%扑海因可湿性粉剂1000倍液，交替使用，每隔7～10天1次，连续喷2～3次。
首先要轮作倒茬，其次要加强田间管理、控制田间湿度，第三要在初发生时选用疫菌清等对症的高效低毒低残留农药田间喷雾防治。
加强水肥管理，预防病虫害发生。
发病初期可选用代森锰锌可湿性粉剂或丙森锌可湿性粉剂等药物防治。
可用代森锰锌、霜疫霸喷雾。
选择抗病品种，加强肥水管理，发病期用百菌清防治。
辣椒忌连作，也不能与茄子、番茄、马铃薯、烟草等同科作物连作。栽培辣椒地块，要排水良好，排灌方便，并要求深耕。最好能做到冬耕，休闲冻土，以改良土壤，消灭越冬害虫和病菌孢子。
