在发病初期，用75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或50%扑海因可湿性粉剂1000倍液，或64%杀毒矾可湿性粉剂600倍液等，交替使用，每隔7～10天1次，连续喷2～3次。
辣椒早疫病可以在病发初期用噻唑锌兑水均匀喷防2次。
化学防治。幼苗期喷药，带药定植。播种时可用50%多菌灵可湿性粉剂按1∶（300~500）的比例拌干细土灰，播撒适量药土覆种。待辣椒出苗后每隔10天左右，撒施少量药土。露地栽培在发病前，开始喷50%异菌·福可湿性粉剂800倍液或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、50%多·硫悬浮剂500倍液、75%百菌清可湿性粉剂600倍液、64%噁霜灵可湿性粉剂500倍液、68%精甲霜灵·锰锌水分散粒剂300倍液、44%精甲霜·百菌清悬浮剂500~650倍液，药剂防治宜早，要喷在叶背，隔7~10天喷1次，连续3~4次。
辣椒早疫病可选用绿亨飓风70%烯酰·嘧菌酯或80%烯酰吗啉水分散粒剂2500倍液喷雾，或选用72%霜脲·锰锌可湿性粉剂500~1000倍液喷雾，隔7-10天再喷一次，连续2-3次。
可用吡唑醚菌脂、苯醚甲环唑等药剂防治。
发病初期可用64%杀毒矾可湿粉剂500倍液喷雾、800倍液灌根；77%可杀得可湿性粉剂500倍液喷雾、800倍液灌根；58%甲霜灵锰锌500倍液喷雾、800倍液灌根。每隔7～10天喷一次，连续2～3次，严重时每隔5天喷一次，连续3～4次。
