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matlab主成分分析综合评价算法 主成分分析(PCA)算法介绍及matlab实现案例

时间:2018-09-09 12:26:49

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matlab主成分分析综合评价算法 主成分分析(PCA)算法介绍及matlab实现案例

主成分分析经常被用做模型分类时特征的降维,本篇首先介绍PCA的步骤,并根据步骤撰写对应的MATLAB代码,最后指明使用PCA的步骤。

我们在做分类时,希望提取的特征能够最大化将数据分开,如果数据很紧密,模型就比较难将其分开,如果数据比较离散,那么就比较容易分开,换句话说,数据越离散,越容易分开。

那怎么让数据离散呢?离散又用什么指标衡量呢?

统计学的知识告诉我们,数据越离散,方差越大。

因此,PCA的问题就变为:寻找一个坐标轴,使得数据在该坐标轴上面离散度最高。也就是寻找一个基使得所有数据在这个基上面的投影值的方差最大。

那具体怎么做呢?科学家们已经帮我们做好了,如下步骤:

设有m个样本,每个样本有n个特征,组成m行n列的矩阵

1)将每一列特征进行均值化处理,特征归一化,也称为数据中心平移到坐标原点

2)求取协方差矩阵

3)求取协方差矩阵的特征值和特征向量

4)将特征向量按对应特征值大小从上到下按行排列成矩阵,取前K列组成系数矩阵

matlab代码

function [coffMatrix,lowData,eigValSort,explained,meanValue] = myPCA(data)

%data为row行col列矩阵,row为样本数量,col为特征列,每一列代表一个特征

[row , col] = size(data);

% 求出每一列的均值

meanValue = mean(data);

% 将每一列进行均值化处理,特征归一化,数据中心平移到坐标原点

normData = data - repmat(meanValue,[row,1]);

%求取协方差矩阵

covMat = cov(normData);

%求取特征值和特征向量

[eigVect,eigVal] = eig(covMat);

% 将特征向量按对应特征值大小从上到下按行排列成矩阵

[sortMat, sortIX] = sort(eigVal,‘descend‘);

[B,IX] = sort(sortMat(1,:),‘descend‘);

coffMatrix = eigVect(:,IX);

% 排序后的特征向量就是新的坐标系

lowData = normData * coffMatrix;

% 分量得分

explained = 100*B/sum(B);

%特征值

eigValSort = B;

%%

% [U,S,V] = svd(data);

end

我们在实际应用PCA的时候需要注意保留以下几个值。

1、每个特征的均值meanValue,用于验证集和测试集的归一化

2、系数矩阵coffMatrix,用于求取转换后的训练数据,和转换后的验证数据,测试数据

3、各分量的得分scores,用以确定最终的所需要的维度。

下面借鉴matlab帮助中心的例子实现撰写以下代码:

clc

clear

creditrating = readtable(‘CreditRating_Historical.dat‘);

creditrating(1:5,:);

X = table2array(creditrating(:,2:7));

Y = creditrating.Rating;

XTest = X(1:100,:);

XTrain = X(101:end,:);

YTest = Y(1:100);

YTrain = Y(101:end);

[coeffMatrix,scoreTrain,eigval,score,meanValue] = myPCA(XTrain);

sum_score = 0;

idx = 0;

while sum_score < 95

idx = idx + 1;

sum_score = sum_score + score(idx);

end

idx

scoreTrain95 = scoreTrain(:,1:idx);

mdl = fitctree(scoreTrain95,YTrain);

%关键步骤:1、测试集减去均值,均值是训练集各个特征值的均值

for i=1:size(XTest,1)

XTest(i,:) = XTest(i,:)-meanValue;

end

%关键步骤:2、均值化之后的值乘以训练集的系数矩阵(新基),转化为该基下来对应的值

scoreTest95 = XTest*coeffMatrix(:,1:idx);

% 新基下面的值作为预测数据

YTest_predicted = predict(mdl,scoreTest95);

matlab中也有自带的pca函数

[coeff, score, latent, tsquared, explained, mu] = pca(x,varargin);

详细的参数说明可以通过在命令行输入 docpca查看

帮助中心中有丰富的例子可以帮助理解。

原文:/xhslovecx/p/12849449.html

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