【据《Current Opinion in Microbiology》5月在线报道】题：肺炎克雷伯菌是耐药基因从环境向临床传播的重要载体（作者：Wyres, Kelly L. Holt, Kathryn E.）
ESKAPE是临床上耐药情况十分严重的几类细菌的总和，而且他们的耐药基因主要是通过基因水平转移获得的。耐药基因原先都存在于自然环境的细菌中，但是在临床抗生素的筛选作用下，耐药基因开始在临床菌株中出现，并与抗生素的应用存在典型的时间延迟。
肺炎克雷伯菌已经被报道存在有数百种耐药基因，并且其中许多耐药基因都是在肺炎克雷伯菌上首次报道。例如：1、导致肺炎克雷伯菌氨苄西林天然耐药的SHV-1基因，原来存在于其染色体上，1973年该基因首次在质粒上被发现。2、20世纪80年代，三代头孢问世，TEM，SHV，CMY均在肺炎克雷伯菌中首次被发现。3、20世纪90年代，喹诺酮类和碳青霉烯类药物问世，介导喹诺酮类耐药的qnrAB首次在肺炎克雷伯菌中发现，并发现其祖先为海洋环境菌shewanella；碳青霉烯耐药相关基因KPC，NDM-1，OXA-48也均在肺炎克雷伯菌中首次发现。
通过大数据分析发现，肺炎克雷伯菌的耐药基因含量十分高，是大肠埃希菌的两倍（图1a），说明其从环境微生物中通过基因水平转移可以获得更多的耐药基因。且肺炎克雷伯菌的基因组具有更高的可变性，肺炎克雷伯菌核心基因组包含约2000个基因，附属基因组包含约3500个基因，核心基因组上GC比例约为58%，但是附属基因GC比例的变化范围在20%-70%之间，说明附属基因的起源差异大（图1d）。另外，肺炎克雷伯菌质粒含量高，并且有研究指出，相较于大肠埃希菌，肺炎克雷伯菌携带质粒后的适应性代价较小，对质粒具有较高的容受性（图1b）。
图1ESKAPE和大肠埃希菌，耐药基因、质粒和基因组特征
基因水平转移的发生需要细菌位于相同的生态位中，肺炎克雷伯菌不仅本身具有良好的获得耐药基因的能力，并且在环境生态位的分布广泛，有利于基因发生转移。20世纪70-80年代，有研究指出，淡水、咸水、植物和土壤中都有肺炎克雷伯菌的存在，且在动物中可以引起相应的感染。虽然在动物中，大肠埃希菌是肠道微生态的重要组成成分，但是在无机环境中，肺炎克雷伯菌的分布明显高于大肠埃希菌。临床上流行的肺炎克雷伯菌ST型，在环境中也有发现，比如与产ESBL相关的ST15型细菌，在猫和狗中被发现；高毒力相关克隆ST23型，在灵长类和猪中被发现。这些菌株提供了相关证据，证明有少数菌株可以在不同的环境生态位中存活，从而为基因交流提供机会。
综上所述，肺炎克雷伯菌的耐药基因多样性，质粒的容受能力，广泛的生态位分布，都是导致其在基因交流中成为重要媒介的原因（图2）。
图2肺炎克雷伯菌耐药基因和质粒的传播模式图
（浙江大学医学院 史秋橙、俞云松 报道）
原文链接：/10.1016/j.mib..04.004
