南京信息工程大学，位于江苏省南京市。是江苏省重点大学，是世界一流学科建设高校。学校前身为1960年组建的南京大学气象学院，1963年独立建校为南京气象学院，1978年列入全国重点大学。更名为南京信息工程大学。
南京审计大学，位于江苏省南京市。是江苏省属全日制普通本科院校，省部共建高校。学校前身是1983年成立的南京财贸学院。1987年更为南京审计学院。2002年南京金融高等专科学校并入。升级为南京审计大学。
南京审计大学是改革开放之后才成立的学校，主要是为了适应经济发展需要而建立的财贸类学科，也是为了弥补江苏省内的空白。也是基于这个原因，南京审计大学建校比较晚，所以教学经验和教研积累方面都有所欠缺，最主要的是他的起步教学班底实力就比较弱，都是临时抽调的人员，想不弱也比较难。而南京信息工程大学则没有这些问题，他建校班底是原南京大学的相关院系实力极其强劲。而且建校较早，教学经验和教研积淀都很丰富，绝对是一所实力派高校。两所学校另外一个不同就在于南京信息工程大学早在1978年就已经是全国重点大学了，而同期的南京审计大学尚未出生，两校实力差距之大，实在难以想象。
根据教育部第四轮学科评估结果来看，南京审计大学有1个B类学科，2个C类学科，其中最高评级为B级的工商管理；南京信息工程大学有1个A+学科，4个B级学科，7个C类学科，其中最高评级为A+级的大气科学。相对来看，南京审计大学的学科建设稍差一些。
综合来看，南京信息工程大学的实力完胜南京审计大学。
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