1.实证
(1)邪热内结：
治宜清热消痞。代表方泻心汤(大黄、黄芩、黄连)，胸闷加瓜蒌，恶心呕吐加竹茹，口渴加花粉。
(2)饮食积滞：
治宜消食导滞，和胃降逆。代表方保和丸合平胃散加减(山楂、神曲、莱菔子、陈皮、半夏、茯苓、苍术、厚朴、枳实、连翘)。
(3)痰湿内阻：
治宜燥湿化痰、理气和中。代表方平胃二陈汤(苍术、半夏、厚朴、陈皮、茯苓、甘草)。气逆噫气不除加旋复花，胸膈满闷加瓜蒌、薤白，痰黄，口干加黄芩。
(4)肝郁气滞：
治宜疏肝解郁，理气消痞。代表方越鞠丸(川芎、苍术、香附、炒山栀、神曲)加味，气郁甚加木香、枳壳，痰多加陈皮、半夏。
2.虚证:
治宜健脾理气。代表方香砂六君子汤加味(党参、黄芪、白术、茯苓、半夏、陈皮、木香、砂仁、内金、枳壳)。若脾阳虚，加干姜，温运中焦，振奋脾阳。 命火不足加附子、肉桂，脾肾同治。若脾虚而又水热互结、虚实相兼者，可用仲景泻心汤意，既调补脾胃，又辛开苦降，和中消痞。半夏、黄芩、黄连、生姜、干 姜、党参、炙甘草、大枣。
中药
(1)香砂六君子丸(《中国基本中成药》)：益气健脾，理气和胃，治脾虚气滞，胃部胀痛。
(2)枳木丸(《中国基本中成药》)：健脾化食，行气消痞，治脾虚气滞食积，胃胀胃痛。
(3)平胃散(《实用中成药手册》)：燥湿运脾，宽胸消胀，治湿浊中阻，胸满腹胀。
(4)香砂养胃丸(《中国基本中成药》)：健脾祛湿，和胃畅中，消胀除满。
(5)加味保和丸(《中国基本中成药》)：消食导滞，利湿和胃。
(6)越鞠保和丸(《中国基本中成药》)：解郁舒气，和胃消食。
(7)左金丸(《中国基本中成药》)：泻肝清胃，治肝胃热郁，泛酸灼热。
预后
功能性消化不良是一种良性胃肠道功能性疾病，经适当治疗可得到有效控制，其预后良好。
