浅蓝线表示亲子关系，红线表示婚姻关系；
加粗黑色字写的是曾经在位的各国君主，数字标注的是在位时间；
左侧是神圣罗马帝国的皇帝们和西班牙的国王们，右边是英格兰和苏格兰的王室。
这些君主往往头衔众多，子女也众多，我只画出了这篇答案需要提及的。
题主问的三位女王都是英国历史上非常有名的人物，所处年代是16世纪。
玛丽一世出生于15，1553年37岁继位，1558年42岁病逝，在位5年。
伊丽莎白一世出生于1533年，1558年25岁继位，1603年70岁病逝，在位45年。
以上两位英格兰女王是同父异母姐妹。父亲是亨利八世。姐姐比妹妹大17岁。
玛丽·斯图亚特出生于1542年，出生6天即成为苏格兰女王，1567年25岁被迫退位，1587年45岁时被处极刑。
玛丽·斯图亚特的祖母玛格丽特与亨利八世是亲姐弟，因此，尽管她只比伊丽莎白一世小9岁，但两个人并不同辈，而是表姑与表侄女的关系。这是一个不近也不远的亲戚关系，有大家庭的人可能比较容易理解。
在绝大部分讲述她们的故事的书里，都会提到新教和天主教的争斗，这的确是那个时代的英国的主要矛盾。而这个矛盾的产生就说来话长了，所以这里就长话短说。
西方历史，宗教和政治都有重要的影响力，教权和王权长期拉锯。国家和政权上，如果想要有个提纲挈领的思路的话，按照“罗马帝国→法兰克王国→神圣罗马帝国及其它欧洲国家”来看就大致能看懂。
宗教上，基督教主要是分三大派别，分别是新教、天主教和东正教，这其中，天主教和东正教的争执的历史较悠久，打从罗马帝国分裂的时代就不和谐了。
原本，基督教是罗马帝国的国教，但是没多久，罗马帝国就在公元395年一分为二，西罗马帝国以罗马为核心，东罗马帝国以君士坦丁堡为核心。
此后公元5世纪后期，西罗马帝国灭亡，罗马教廷继续在欧洲大陆西部和中部发展势力；东罗马帝国（在历史上也常被称作拜占庭帝国）政权则继续坚持，7世纪达到全盛，后来，随着东边的伊斯兰教国家的发展，东罗马帝国应付得越来越吃力，逐渐成了西边罗马教廷和东方伊斯兰教之间的夹心馅。
公元962年，德意志国王被罗马教廷加冕为罗马皇帝，后来腓特烈一世又把国家也改名叫神圣罗马帝国，宣称自己的皇位是来自罗马帝国。
再后来到了公元1054年，东西教会大分裂。西边认罗马教廷，自称公教（也就是天主教）；东边组成了东罗马正教会，强调自己是罗马帝国及其国教的正统，形成了东正教。
之后，东罗马帝国逐渐走向衰亡。最终，1492年，莫斯科大公伊凡三世娶了东罗马帝国的索菲娅公主，宣称自己是东正教的保护人。他的孙子伊凡四世后来成了俄罗斯帝国的第一位沙皇。
在俄罗斯南边，奥斯曼帝国也宣称自己是东罗马帝国的继承人。
我们现在看到的西欧历史，神圣罗马帝国君主被翻译成皇帝，俄罗斯和奥斯曼土耳其的君主也是皇帝，其它诸国君主则通常是国王或大公之类的，这里并不是说君主的权力可以与我国古代相对应，而是有一个历史惯性和宗教原因存在。
天主教罗马教廷认神圣罗马帝国为正统；东正教则表示不吃天主教这套，他们认自己的保护者俄国为正统；伊斯兰教那就更要表示我们奥斯曼帝国才是正统。
（所以后世的拿破仑自己当法兰西帝国皇帝，要教皇来给他加冕，又自己把皇冠戴上，两年后强行要求弗朗茨二世放弃神圣罗马帝国皇帝称号，改称奥地利皇帝，这一系列的公然挑战天主教正统的行为，都蛮惊人的。）
回到三位女王所在的16世纪，西欧当然以天主教为主流，英格兰和苏格兰却有变化，信新教的多。英国和波西米亚地区本来就是天主教圈的边缘地带，14世纪威克里夫改革，15世纪教会自己也有很多令人不满的行为，比如滥征税、占用土地、滥用司法权，加上文艺复兴的影响，欧洲大陆上的天主教自己也在改革，最终结果是，亨利八世统治期的英国，新教更盛。
赶上亨利八世自己也想要个男性继承人，而王后凯瑟琳生的孩子又只有一个玛丽公主没夭折，王后已经过了适合生育的年纪，亨利八世就想跟凯瑟琳离婚，娶安妮·博林。
天主教是严格执行一夫一妻制的，多妾什么的不允许，非婚生子女一律算私生子女，没有继承权，结过婚又离婚的话，孩子也会被算成私生子女，也没有继承权。亨利八世相信安妮·博林一定能生下儿子，当然要跟她正式结婚，才好让王子成为合法继承人。
上图是1550年的欧洲，蓝线圈起来的是神圣罗马帝国，明黄色部分是西班牙，当时在南欧各处都有国土。
然而，这婚不是说离就能离，亨利八世的王后凯瑟琳，是西班牙女王伊莎贝拉一世的小公主（就是那个资助过哥伦布的伊莎贝拉一世）。
而凯瑟琳的姐姐胡安娜一世嫁给了腓力一世，神圣罗马帝国皇帝马克西米利安一世的儿子，结果，胡安娜一世和腓力一世的儿子查理五世，既是神圣罗马帝国皇帝也是西班牙国王。
凯瑟琳和亨利八世闹离婚的时候，查理五世正好在位。在地图上，我们可以看到凯瑟琳王后的这位外甥在欧洲的存在感有多强。当时的教皇并不想惹查理五世不高兴，就不答应亨利八世离婚。
亨利八世不肯罢休，历史、法律、财政、文化多管齐下，一通运作，还真就把宗教改革的事情办成了，这对英国社会当然影响很大。
不过，玛丽一世仍然信天主教，这不仅仅是因为在她成长的岁月，天主教依然是西欧各王室尊奉的正统教派，也因为她爹搞宗教改革，直接打击的对象就是她的母亲。她对反对天主教的人有很大火气，这属于人之常情。可她是女王，“天子之怒，浮尸百万，流血千里”，说得比较夸张，用在玛丽一世身上也太过，史籍记载她下令烧杀的人数，不超300，但以手段来说，的确残酷，她也为此被叫做“血腥玛丽”。
玛丽一世的另一个不受支持的举动是坚持嫁给腓力二世。其实这个选择，也可以理解，腓力二世是她的娘家人，在欧洲找到西班牙这么个强大的合作者，会让英格兰在国际关系中不那么边缘。
但因为这样的关系是通过女王出嫁的形式实现的，直接结果就是英格兰完全被绑在了西班牙的航船上，而当时的英格兰并没有实力与狼共舞，于是就搞得十分狼狈，被卷进跟法国的战争，丢了加莱。
伊丽莎白一世接手的是一个教派闹分裂、国力不给力的国家。而年仅25岁的她，表现出了一个政治家应有的冷静和智慧。她召开议会，让大家辩论，修改掉最激进的法条，整体采取让两个教派和解的思路。
当然，教派之间没有那么容易和解。所以她是以法律的手段，对实在不接受英国国教的天主教徒和清教徒，也只能镇压。如果要说历史上杰出的帝王做事与常人的不同之处，当中一定有一条，就是他们关键时刻能从现实出发，不考虑个人经历或感情。
伊丽莎白一世处理宗教问题的手段，就没有多少私人感情的色彩，从她的做法，不太能看出跟她早年的经历有多大关系，是那种“正常的政治家都会这么做”的选择。
国内处理得不错，在对外关系上，伊丽莎白一世也具备一个杰出的君主必备的优点：坚持独立自主的精神。同样是宗教问题，虽然对国内采取了缓和矛盾的策略，但对罗马教廷她是没有妥协的，自立英国国教，任命大主教，这实在是自立门户的行为。
而在国际关系上，可以说，伊丽莎白一世是个空手套白狼的高手，她把自己的婚姻拿来跟各国君主开空头支票。大家都或多或少以为她怎么也要结个婚，可是她最终却选择独身。在那个时代，以一个女人来说，这么做毫无疑问是出乎绝大多数人的意料，但英国也避免了再被别的国家当枪使的命运。
看得出，杰出的君主对内和对外是不同的。对内尽管要打击组织内部的破坏分子，但对大部分人还是要想办法让大家和气生财；对外虽然需要尽量保持友好，但必须有个自主独立的大前提。
如果要比较玛丽一世和伊丽莎白一世的话，恐怕后者是完胜的。
玛丽一世的政策虽然可以理解，其为政举措也不是都不好，但在最关键的问题上，她的选择带来的结果不佳，除了对外让国家丢失国土之外，对内处理宗教问题也给自己留下了“血腥玛丽”这么一个实在不好听的称号。至于个人生活，玛丽一世真的想要有孩子，但是一直没有，想要的始终得不到，也不能算好事。
而伊丽莎白一世虽然也没孩子，但她本身倒能看得开，晚年倾向于让玛丽·斯图亚特的儿子詹姆士继位。能跟一个与自己半生为敌的人的儿子维持还不错的关系，也算是可以接受的结局了。
当然，玛丽一世的人生虽然没有伊丽莎白一世辉煌，但她跟另一些同时代的王室女性比起来，已经可以算幸运了，比如那个被她推翻的九日女王简·格雷，一生仅，没有成就也没有爱情，短短九天的女王称号也不受史家承认，相比之下，玛丽一世至少以正式的女王名分留名史册。
另一边的苏格兰，玛丽·斯图亚特仅5岁就被送往法国，受到法国国王的喜欢，也得到了法国宫廷的教育，自然，信的也是西欧的天主教。在她自己的回忆中，她18岁之前在法国的日子过得很好，但随着小他一岁的弗朗索瓦二世病逝，法国有了新的国王和王后，她变得不再重要。
因为她是苏格兰女王，所以她回到了苏格兰。当时她的母亲也已经不在了。一开始，苏格兰贵族欢迎年轻的女王回来，但当他们发现女王信天主教而不是苏格兰大多数人信的新教，他们开始不满。
玛丽·斯图亚特被新教徒不信任，他们拿她是女孩说事，建议她找个新教徒的丈夫来帮她治理国家。出于很自然的想要孩子继承王位的心情，玛丽·斯图亚特开始寻找丈夫。顾及苏格兰贵族们的感受，她没有嫁给信天主教的西班牙国王的儿子。
作为外交需要，她也曾试图跟伊丽莎白一世建立友好的关系，不过伊丽莎白一世给她介绍的对象她可不喜欢，觉得伊丽莎白一世将其情人罗伯特·达德利介绍给她，是想让这个情人当上苏格兰国王。
而在爱上达恩利勋爵之后，玛丽·斯图亚特不顾同父异母弟弟马里伯爵的反对，嫁给了勋爵，惹得伊丽莎白一世和很多英格兰贵族也很不高兴。不过这还不算什么致命问题，因为此时的马里伯爵还打不过姐姐，只能逃去英格兰。
所以，玛丽·斯图亚特和达恩利在一起，开始时还是幸福的。
但在婚后，苏格兰女王发现她的丈夫对政务全无兴趣，对她没有帮助，这就不是她想要的了。玛丽·斯图亚特找丈夫是希望丈夫帮她出主意看公文、帮她治国，那段时间她又怀上了詹姆士，身心俱疲，就常常跟达维·里奇奥在一起，这个人能帮助她。达恩利对此十分恼怒，杀掉了里奇奥。马里伯爵以此为名打了回来，达恩利无力招架，逃跑途中，博思韦尔勋爵帮助女王重回爱丁堡。
之后，达恩利被玛丽·斯图亚特认为经常出轨。1566年6月，未来的詹姆士一世出生，达恩利也没来给孩子取个名字。因为里奇奥被杀的事情，玛丽女王自己也不爱达恩利了。
1567年2月9日，已经是亲王的达恩利遭到暗杀，博思韦尔被相当多的人怀疑是主谋，玛丽·斯图亚特则坚持认为不是博思韦尔做的，虽然也知道自己不能在丈夫死之后这么快就又结婚，但她还是在5月份嫁给了博思韦尔勋爵。
这就很尴尬了，本来苏格兰就是有一波反对玛丽女王的势力存在的，现在她这么快就跟谋杀丈夫的嫌疑人结婚，她在大家眼里就成了共犯。在这种极不得人心的情况下，玛丽·斯图亚特和博思韦尔勋爵的军队毫无作战意志，反对势力胜出。玛丽·斯图亚特先是被关起来，流产了双胞胎，继而被迫退位，博思韦尔后来也死在了丹麦的监狱中。
但在这段时间里，虽然主流舆论因为达恩利的事对玛丽·斯图亚特非常不满，却并不完全支持马里伯爵。伊丽莎白一世出于同样作为女王的立场，写信给马里伯爵，义正辞严地说：“你不能囚禁一个女王，这是极其错误的。”
很多时候人与人之间的关系真的没有那么简单，伊丽莎白一世和玛丽·斯图亚特半生为敌，但她们也是同类。到了最关键的时刻，伊丽莎白一世会想到玛丽·斯图亚特也是女王，君是君，臣是臣，她不能允许臣对君无礼。而事情就复杂在，她俩是同类，却不是同盟。
在又一次战败给马里伯爵之后，玛丽·斯图亚特逃到了英格兰，以为伊丽莎白会出于同类的立场帮助她，但是她忘了她对伊丽莎白一世来说代表着天主教势力，她们俩是政敌。对伊丽莎白一世来说，只要马里伯爵不对国君失礼，让詹姆士做苏格兰国王更有利，他们可以让他信新教。
从此，长达二十年，伊丽莎白一世对玛丽·斯图亚特的存在感到异常棘手，杀也不是放也不是，只能一直监禁，直到英格兰贵族们忍无可忍，组织法庭判玛丽·斯图亚特死刑。
英格兰贵族们当然有着很充分的理由：国家安全、女王安全，毕竟玛丽·斯图亚特涉嫌阴谋活动，她的存在也让天主教势力心存希望。
但伊丽莎白一世不希望玛丽·斯图亚特因为法庭审判而获刑，因为这在那个时代，会传递给世界一个信号：法庭可以判君主有罪并处以刑罚。这当然是作为君主的伊丽莎白一世并不希望看到的，无论有没有罪，君主至少有面对法律时人身不受伤害的权利。
除了这个理由，更现实的问题也在眼前，腓力二世是不想看到玛丽·斯图亚特出事的，如果杀掉她，那就等于是跟西班牙翻脸了。
伊丽莎白一世与玛丽·斯图亚特比较起来，因为后者的执政几乎完全失败，两次婚姻又导致了祸不单行，所以无论怎么看，都是伊丽莎白一世显得更成熟理性。
但也不能说玛丽·斯图亚特就有多笨或是多坏，她从小长在天主教的环境中，坚定地信天主教，这不能算是什么罪恶。她相信博思韦尔没有杀达恩利，没能给自己赢得民心，也只能说她有她的坚持和性情。
如玛丽·斯图亚特自己所说，她生是天主教徒，到死也是天主教徒，一生也算求仁得仁。如果还可以与更多人比较的话，后世嫁到俄国的叶卡捷琳娜二世，嫁过去就改信东正教，学俄语，做得甚至比自己丈夫、名正言顺的沙皇彼得三世还要得人心，以至于兵变上台后顺利统治俄国，被尊为大帝，那也是一种人生。
至于个人生活方面，玛丽·斯图亚特可能的确找到了真爱，但并没有得到幸福，相比之下，后世的维多利亚女王有个能帮她的丈夫，想必会很令她羡慕吧。
三个人放在一起比较的话，玛丽一世在历史上更多是一位过渡君主，玛丽·斯图亚特留下的更多是悲剧故事，而伊丽莎白一世则无愧于荣光女王的称号。
苏格兰玛丽女王死的那年是公元1587年，这个年份非常凑巧，历史学家黄仁宇曾经写过一本书，《万历十五年》，万历十五年就是公元1587年。这一年的明帝国已经走向衰亡，英帝国的好运才刚刚开始。
转过年来的1588年，腓力二世组建了著名的无敌舰队，但是被英军打败。虽然不是彻底打垮，但这证明了无敌舰队并不是不可战胜，从此，英国朝着海上霸权的路越走越远，其影响力直到今天。
有句话说，玛丽·斯图亚特的人生在25岁时其实就已结束，伊丽莎白一世的人生到25岁才刚刚开始。历史就是这样，既是英雄造时势，也是时势造英雄。不能顺应时势的话，即使能登上历史舞台，也会很快被淘汰，而能顺应时势的，就要看能力如何，伊丽莎白一世毫无疑问是能力出众的一位君主，英国能有后来的光辉，她是要记一功的。
