针对连续两年来大面积发生的玉米顶腐病，首先要趁早对症下药，准确用药。发现病害后要立即喷施碧秀丹(50%氯溴异氰尿酸可溶性粉剂）600倍液、细康800倍液或细马（2%春雷霉素可湿性粉剂）800倍液均匀喷雾。叶枯唑和农用链霉素已产生严重抗性，建议不要使用。
在田间看到明显发病植株时，病害已进入严重发生阶段，此时再用药，效果较差。针对镰刀菌顶腐病可以使用翠尔（46%多抗锰锌可湿性粉剂）800倍液或使用50%氯溴异氰尿酸可溶性粉剂600倍液心叶喷雾或滴心，也可以混加金盾叶面肥增强植株抗病性。其次是进行农业防治。如果叶片已严重腐烂并粘连在一起，应立即用刀片挑开粘连的叶片，以利于雄穗的正常吐穗，并将剪下的病叶带出田外深埋处理。
