和许多热带和***带果树的种子一样，荔枝种子以即采即播为好，一般贮藏则极易丧失发芽力。据华南农业大学试验：荔枝种子剥离果肉5天，仅有5％的发芽率。在生产中为了使种子既能贮藏较长时间（如远运、避开不利播种期、有利于劳力的安排等），又能保持较高的发芽率，可将种子消毒、稍晾干后，用塑料薄膜袋装，并扎紧袋口，每袋1一2公斤，放于室内阴凉处，则贮藏120天，仍保持100％的发芽率。这是因为在扎紧袋口的塑料袋中，保持了一定相对稳定的湿度，种子不易因过分干燥而失去发芽力，且在密封情况下，由于种子的呼吸作用（吸收氧气，放出二氧化碳），而使袋中的氧气减少，二氧化碳增加，种子的生命活动减弱，养分消耗减少。另一方面，由于湿度不大，氧气不足，种子不萌发或极少萌发，因而能保存较久而维持较强的发芽力。但要注意定期打开袋口，清除霉烂种子并抹干水珠，翻动种子，以免湿度过大，温度增高（由于呼吸作用放出热量）,使呼吸作用加强，致袋中氧气缺乏，种子缺乏维持微弱生命活动的氧气而进行无氧呼吸，引起发酵败坏，或因霉菌增殖而腐烂。如果能结合低温（如5℃）贮藏，效果更好。
