近日，国际顶级期刊《Nature》发表了一篇题为Isolation of SARS-CoV-2-related coronavirus from Malayan pangolins的研究论文，文章指出新冠病毒的中间宿主是穿山甲可能性较大。
文章的团队是之前介绍过的华南农业大学的沈永义团队，他们曾经开发布会指出新冠病毒可能来自穿山甲，并发表了相关论文在这次研究中，从马来穿山甲中分离出的一种冠状病毒，该病毒的E，M，N和S基因中与SARS-CoV-2的氨基酸相似性分别是100％，98.6％，97.8％和90.7％
比较有意思的是，基因组序列和氨基酸序列之间的相似度有时候还存在相左的结果。
比如，对于S蛋白，如果是看基因组序列的话，蝙蝠的RaTG13比新冠的WHCV相似度更高（88.5% vs 84.5%），但是如果看氨基酸序列的话，蝙蝠的RaTG13比新冠的WHCV相似度要低（89.8% vs 90.7%）。
而最为关键的是，对于新冠病毒最核心的S蛋白受体结构域来说，氨基酸角度上，新冠和穿山甲病毒只有1个不重要的氨基酸差异。
同样，用比较基因组来研究，发现，新冠病毒可能是穿山甲病毒和蝙蝠病毒的重组。
Further comparative analysis of the S gene sequences suggests that there were recombination events among some of the SARSr-CoV analyzed.
在新冠s基因的1-914位置，穿山甲的病毒和蝙蝠病毒相似度高（Bat SARSr-CoV ZXC21 and Bat SARSr-CoV ZC45），而在其他位置，穿山甲的病毒和新冠相似性更高（SARS-CoV-2 and Bat-CoV-RaTG13）
如上图所示，左侧的灰色区域和右边的橙色区域，明显可以看出比对率的差异，左右是反过来了。
换个图，从进化角度也可以看出
而出现这种交叉的情况，很大可能是发生了基因重组，也就是说，新冠病毒可能是来自于蝙蝠病毒和穿山甲病毒的重组（说明，不一定是现在那个病毒，严谨的说，叫做类似病毒，因为我们看到的其实已经是进化后的结果了， recombination of a Pangolin-CoV-like virus with a Bat-CoV-RaTG13-like virus ）
当然了，文中还有组织检测实验，证实穿山甲病毒可以引发感染症状。
—————保护穿山甲—————
这次发现携带病毒的是马来穿山甲，是一种哺乳动物，下图是它的分类
下图黄色区域是马来穿山甲的生活地方，他们被走私后进入了中国，最后到了武汉。
为什么要走私呢？因为中华穿山甲被人们干的濒危了，属于国际保护上的极危动物，几乎就要野外彻底灭绝了（CR，Critically Endangered表示该物种所面对的威胁及危机等级为极高，是仅次于灭绝及野外灭绝的评级）。
灭绝原因中，药用是一个重要的部分
但是，这里有个问题难以解释，就是，为什么沿途没有爆发，到了武汉爆发了呢？
而从这个病毒的序列和武汉病毒的一些差别来看，极有可能是，它们在武汉那个地方发生了变异。这也是为什么我们看到武汉病毒扩散的时候有个mv1
不管如何，个人觉得，对于穿山甲，是时候整理一下我们的看法了，该不该吃？
———为什么要寻找中间宿主———
如果我们无法找到中间宿主，那么这意味着潜在的风险仍然存在，说不定在某个地方还存在感染病毒的中间宿主，随时可能来一次引爆，因此必须寻找中间宿主。
当然，为什么判定有中间宿主，主要是因为病毒直接从蝙蝠到人身上，那难度太高了，毕竟相差太远，病毒感染也为难，且序列存在较大差异。一定有个中间宿主在发挥作用，让整个病毒在中间宿主上继续发生进化，直到其更容易感染人类。事实上，中间宿主是蝙蝠感染的常见历史，SARS，MERS都是蝙蝠通过中间宿主感染了人
所以这次大家也纷纷寻找新型冠状病毒的中间宿主，而从目前的研究来看，穿山甲是中间宿主的可能性较大，这提示我们要对穿山甲本身加强管理，无论是走私还是药用等。
