抗生素耐药性是当今世界日趋严重的健康威胁,仅在美国每年就可导致2万人死亡。而鉴定特定的抗生素抗性微生物是迅速和恰当治疗的关键。就算是在缺乏暴露的情况下,环境中的细菌也能够扮演抗性基因储备库的角色。随着气候变化和永冻土解融,抗生素抗性微生物可能以数倍的速率增长。
来自美国阿拉斯加大学费尔班克斯分校的副教授Devin Drown结合使用纳米孔长读长MinION测序仪和自动文库制备仪VolTRAX来发掘未经培养的抗菌素抗性储库,地下微生物群落与地上植物健康之间的联系,以及评估北极和亚北极地区微生物群落的变化。
研究小组从一个芽孢杆菌(Bacillus mycoides)TH26样本中获得了14Gb的全基因组数据,平均读长长度为3.2Kb,能够生成98.2%的完整组装。使用一个癌症细胞系BCBL-1,研究小组还对自动化VolTRAX的文库制备和MinION测序工作流程进行了测试,最终在单张MinION芯片获得了总共为10Gb的数据,平均读长为7.5Kb。
欢迎观看视频讲座了解
• 如何应用纳米孔测序来了解抗生素耐药性
• 了解地下微生物群落与地上植物健康之间的联系
• 获得使用最新自动化文库制备仪VolTRAX V2版的第一手经验
• 结合MinION和自动化VolTRAX提供的是一种可靠的并且可重复的实验室经验
如果你想与更多研究抗生素耐药性的大咖面对面交流,探讨行业趋势,那么一定不能错过今年9月由Oxford Nanopore Technologies在中国举办的首次纳米孔测序技术大会——NTT 。截止到目前,NTT 北京场参会名额已满,上海场还有为数不多的名额,赶紧加入吧!
上海场日期:9月26日
地点:上海外滩W酒店
报名方式:点击“阅读原文”或者直接打开链接/cn/tt/shanghai 点击申请参会,报名参加
参会费用:标准参会费:¥1350 ,现场注册费:¥2700
会议日程:
NTT 上海场嘉宾介绍:Nature, Science, bioRvix大咖即将出席
NTT 大会三大亮点:
• 汇聚国内外各研究领域的资深学者,带来从热门研究领域到最新前沿进展的学术盛宴。
• 强大的中英纳米孔技术专家阵容,结合现场测序演示,带来别具一格的教学专场,以教-练-答-用的形式,让你拥有从准备-仪器-测序-分析-最终生物学结果的完整体验。
• 热门研究领域&新兴前沿进展:微生物组、临床研究、快速病原菌鉴定、癌症、环境研究、植物基因组,直接RNA测序、全长转录组、结构变异、人群规模基因组学、野外实地测序等。